Nació en Salta el 1º de Marzo de 1792. Comenzó su carrera militar en los "Patricios de Salta" y tomo parte al frente de los "Decididos de Tucumán" en la batalla de este nombre (24 de Septiembre de 1812) y en la de Salta el 20 de Febrero del siguiente año, en el cargo de ayudante de campo del General Eustoquio Diaz Vélez. Concurrió a la tercera campaña del Alto Perú combatiendo en Puesto del Marques, Venta y Media y Sipe Sipe, después de la cual paso al ejercito de los Andes que San Martin organizaba en Mendoza. En la campaña libertadora de Chile peleo en Chacabuco, Cancha Rayada y Maipu, en la que rindio al famoso regimiento "Real de Burgos" que se habia distinguido en diez y ocho batallas ganadas en España.

Asistió a la expedición libertadora del Perú. Hizo en ella, como segundo del general Alvarez de Arenales, la segunda campaña de la Sierra; y como general en jefe, la campaña sobre Puertos Internacionales, siendo derrotado en las batallas de Torata y Moquegua (el 19 y 21 de Enero de 1823). Nombrado por Simón Bolívar Gobernador de los Castillos del Callao, fue aprisionado por los sublevados en la noche del 4 a 5 de Febrero de 1824 y entregado al enemigo, en cuyo poder permaneció hasta la Capitulación de Ayacucho, que puso termino a la guerra de la independencia sudamericana y le permitió regresar a la patria.

En 1827 fue nombrado inspector y comandante general de armas, cargo que renuncio por quebrantos de salud; y en 1829, hallandose accidentalmente en Mendoza fue obligado a recibir el mando gubernativo provisoriamente en reemplazo de D. Juan Corvalan a quien habia derrocado una revolucion; pero invadida la provincia por Juan Facundo Quiroga y Jose Aldao, las fuerzas de Alvarado fueron batidas en los campos del Pilar y este tomado prisionero, siendo tratado por aquel caudillo con toda consideracion y puesto en libertad poco despues.

Elegido Gobernador de Salta, renuncio en Noviembre de 1831 a intimacion de Quiroga y salio desterrado, hasta que el triunfo de Caseros (1852), le permitio regresar al pais. El presidente Urquiza le designo en 1854 su ministro de guerra, cargo que declino en el mes de Noviembre por haber sido elegido nuevamente Gobernador de Salta, cargo que tomo posesion el 15 de Abril de 1855. El acto mas trascendental de su administracion fue la promulgacion de la constitucion provincial dictadad por la convencion constituyente en Julio de ese año; y despues se retiro a la vida privada hasta Abril de 1865 en que, con motivo de la guerra con el Paraguay, fue nombrado inspector general de armas en las provincias de Salta y Jujuy.

Fallecio el general Alvarado en la ciudad de Salta el 22 de Junio de 1872. Adornaban su pecho honrosisimas condecoraciones; desempeño muy elevados y graves cargos civiles y militares; y merecio con su amistad, la confianza de los dos grandes libertadores de America: San Martin y Bolivar.